Elementos transponibles emergen como actores clave en infección por Piscirickettsia
Investigadores chilenos detectaron más de 4.500 elementos transponibles activos, durante la infección por Piscirickettsia salmonis, vinculados principalmente a funciones inmunes y metabólicas.
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Aunque existen estudios sobre cómo el salmón del Atlántico responde a la piscirickettsiosis a nivel genético, todavía quedan bastantes interrogantes sin explorar.
Hasta ahora, la mayoría de los estudios se han enfocado en los genes clásicos, es decir, aquellos que codifican proteínas y que participan directamente en la respuesta inmune, como las citocinas o los marcadores de células T (CD4 y CD8). Sin embargo, hay otro componente del genoma que ha pasado más desapercibido: los llamados elementos transponibles (ET).
Estos elementos móviles son secuencias de ADN capaces de cambiar de posición dentro del genoma. Lejos de ser simples “rellenos”, hoy se sabe que pueden jugar un rol importante en la regulación de genes. En el caso del salmón del Atlántico, de hecho, representan más de la mitad de todo su material genético.
Con esto en mente, investigadores de la Universidad de Santiago de Chile, junto a expertos de las empresas Benchmark Animal Health, IDEVAC y Caleta Bay, decidieron mirar más de cerca qué ocurre con estos elementos durante una infección por Piscirickettsia salmonis.
Para hacerlo, analizaron datos de secuenciación de ARN (RNA-seq) obtenidos del riñón anterior de peces infectados, buscando detectar si los ET se activan y si esa actividad está relacionada con la respuesta del sistema inmune.
Funciones metabólicas e inmunológicas
Los resultados fueron claros: identificaron una activación masiva de estos elementos durante la infección. En total, se detectaron 4.550 ET con cambios en su expresión, y lo más llamativo es que el 84% de ellos aumentó su actividad en los peces infectados.
Además, al analizar los genes asociados a estos elementos, los científicos encontraron que estaban vinculados principalmente a funciones metabólicas e inmunológicas. Esto sugiere que los ET podrían estar participando, directa o indirectamente, en la forma en que el pez responde al patógeno.
En palabras simples, no sólo los genes tradicionales reaccionan frente a la infección, también lo hace esta gran parte del genoma, que podría estar ayudando a coordinar la respuesta del organismo.
“Estos hallazgos revelan una extensa activación transcripcional de elementos transponibles durante la infección bacteriana en el salmón del Atlántico y sugieren una dinámica coordinada de expresión génica y de elementos transponibles como parte de la respuesta del hospedador”, señalaron al respecto los expertos.
Si bien no se pueden inferir relaciones regulatorias causales únicamente a partir de análisis basados en correlaciones, los autores concluyeron que estos resultados proporcionan “un marco cuantitativo para investigar la dinámica del mobiloma durante las interacciones huésped-patógeno en salmónidos”.
Lea el abstract del estudio titulado "Differential activation and gene-coupled transcriptional dynamics of transposable elements during Piscirickettsiosis in Atlantic salmon", aquí.
